El Centro está formado por dos edificios separados por la calle Villarcayo, en las postrimerías del Barrio Santa Catalina, del que toma su nombre. 

El Edificio 1 es el primero que se construyó, se encuentra en la C/ Juan de Juni, adosado al I.E.S. "Cardenal Sandoval y Rojas". En este Edificio se imparte E. Infantil y 1º y 2º E. Primaria. También está ubicado la A.M.P.A. y el despacho de Dirección y la Secretaría del Centro. También se encuentran en este edificio las aulas de Logopedia, Pedagogía Terapeútica, Aula de Autismo, Inglés, Música, Informática y Gimnasio. 

El Edificio II se encuentra en la C/ Villarcayo y es "el edificio de los mayores". Se imparte el 3º, 4º 5º y 6º de E.P.O. En la Planta baja se encuentra la sala de informática, Sala de profesores, Gimnasio y Taller. En la 1ª Planta están las aulas de 3º y 4º de Primaria y en la 2ª Planta las de 5º y 6º, el aula de Música y la de Inglés.